Dezinfekcija označava postupke usmerene na uništenje najvećeg broja neželjenih mikroorganizama. U tu svrhu se koriste fizička i hemijska sredstva. Tim se postupkom uništava, inhibira ili uklanja i ostala populacija organizama. Primjenjuje se izvan živog organizma, u spoljašnjoj sredini (tlu, vodi, vazduhu, na predmetima i u prostorijama zdravstvenih ustanova, fabrikama prehrambenih proizvoda i dr.). 

Važna je činjenica da se dezinfekcijom ne moraju uništiti i bakterijske spore 

Sunčevom svetlošću, te procesima taloženja, filtriranja i razređivanja sprovodi se dezinfekcija u prirodi. Danas je delatnost zdravstvenih ustanova nezamisliva bez primene antiseptičkih postupaka i novih dezinfekcijskih sredstava.

Ako je cilj potpuno uništenje svih živih organizama (uključujući viruse i spore), govori se o sterilizaciji.